中國首個國家基因庫正式對外運營:是全球最大基因庫
歷時5年的建設(shè),9月22日,中國首個國家基因庫宣布正式對外運營。這是繼美國、日本和歐盟之后,全球第四個建成的國家級基因庫,也是目前為止世界最大的基因庫。
本文引用地址:http://butianyuan.cn/article/201609/310307.htm國家基因庫將以生物資源為依托,形成資源到科研到產(chǎn)業(yè)的全貫穿、全覆蓋模式,應(yīng)用方向包括人類健康、新型農(nóng)業(yè)、物種多樣性及生態(tài)環(huán)境保護(hù)等。未來,國家基因庫還將依照相關(guān)規(guī)則開放樣本、數(shù)據(jù)資源,成為一個公共服務(wù)平臺,在基因測序和基因育種等方面發(fā)揮重要作用。
國家基因庫是目前全球最大的基因庫
國家基因庫位于深圳市大鵬新區(qū)觀音山腳下,占地面積超過5萬平方米,建筑總面積11.6萬平方米。其中,一期面積為4.75萬平方米。2011年,該基因庫由國家發(fā)展改革委、財政部、工業(yè)和信息化部、國家衛(wèi)生和計劃生育委員會聯(lián)合批復(fù),并由華大基因最終負(fù)責(zé)承建運營。
深圳國家基因庫主任、華大農(nóng)業(yè)集團(tuán)董事長兼總裁梅永紅曾對媒體表示,國家基因庫選址深圳主要考慮三個因素:一是方便利用臨近的LNG(液化天然氣)碼頭氣化過程中產(chǎn)生的大量冷能,用于冷卻樣品,節(jié)能環(huán)保;二是國家基因庫的主體建筑是倚山體的自然坡度建設(shè)的,每一層都相當(dāng)于是第一層,都有山體結(jié)構(gòu)的支撐,穩(wěn)固性好,可擺放大型設(shè)備;三是深圳正在全力推進(jìn)“東進(jìn)戰(zhàn)略”,將在深圳東部的大鵬半島規(guī)劃建設(shè)國際生物谷,并將其打造成為國際領(lǐng)先的生物科技創(chuàng)新中心,國家基因庫是大鵬新區(qū)的重要產(chǎn)業(yè)基礎(chǔ)設(shè)施,有助于生物產(chǎn)業(yè)提升創(chuàng)新能力。
位于觀音山腳下的國家基因庫
官網(wǎng)資料顯示,深圳國家基因庫初步建成“三庫兩平臺”的結(jié)構(gòu)業(yè)務(wù)和功能,“三庫”由生物資源樣本庫、生物信息數(shù)據(jù)庫和生物活體庫組成,“兩平臺”為數(shù)字化平臺、合成與編輯平臺。國家基因庫搭建起基因資源挖掘的基礎(chǔ)性支撐及公共服務(wù)平臺,以具備對海量生物資源的存、讀、懂、寫、用能力為基礎(chǔ),構(gòu)建起檢測、管理、認(rèn)證、基礎(chǔ)應(yīng)用體系,促進(jìn)基因組學(xué)在精準(zhǔn)健康、精準(zhǔn)農(nóng)業(yè)、海洋開發(fā)、微生物應(yīng)用等方面的前沿探索與產(chǎn)業(yè)轉(zhuǎn)化,催生新技術(shù)、新產(chǎn)品和新模式。
深圳國家基因庫是繼NCBI(美國國立生物技術(shù)信息中心)、EMBL-EBI(歐洲生物信息研究所)、DDBJ(日本DNA數(shù)據(jù)庫)全球三大國家級基因庫后的第四個國家級基因庫,但它與另外三個數(shù)據(jù)庫有著自己獨特的地方。國家基因庫執(zhí)行主任、華大基因研究院院長徐訊在接受央視新聞采訪時稱,與其他三大國家數(shù)據(jù)庫以保存數(shù)據(jù)為主要功能不同的是,深圳國家數(shù)據(jù)庫不僅有數(shù)字化平臺積累別人產(chǎn)生的數(shù)據(jù),還可以保存樣品等,是一個綜合的數(shù)據(jù)庫。深圳國家數(shù)據(jù)庫不僅源源不斷地產(chǎn)生數(shù)據(jù),而且更加注重對于數(shù)據(jù)的研發(fā)、利用,用于產(chǎn)業(yè)發(fā)展。未來,國家基因庫還將依照相關(guān)規(guī)則開放樣本、數(shù)據(jù)資源,成為一個公共服務(wù)平臺。
同時,深圳國家基因庫還與NCBI(美國國立生物技術(shù)信息中心)、EMBL-EBI(歐洲生物信息研究所)、DDBJ(日本DNA數(shù)據(jù)庫)國際知名的數(shù)據(jù)庫、樣本庫開展數(shù)據(jù)交換與資源共享共享,與末日種子庫、德國海德堡大學(xué)、美國史密斯森尼學(xué)會等形成全球聯(lián)盟體系。
技術(shù)人員在進(jìn)行研究工作
基因技術(shù)與人類生活息息相關(guān)
在人類資源方面,基因庫主要保存血液樣本、組織樣本、細(xì)胞系、細(xì)胞和尿液等,將為重大疾病的前瞻性研究提供樣本資源支撐,為疾病診斷與預(yù)測及個性化醫(yī)療等奠定基礎(chǔ)。
在動物資源方面,基因庫主要保存珍稀動物及具有重要經(jīng)濟(jì)價值的動物組織、細(xì)胞等。
此外,國家基因庫除了存儲人類資源、動物資源以外,還存儲植物資源、海洋資源和微生物資源。這些都可以為日后的研究工作收集大量的信息。
國家基因庫一年有5PB的數(shù)據(jù)量,相當(dāng)于是1000萬個孕婦產(chǎn)前診斷的數(shù)據(jù)。如今,國家基因庫已實現(xiàn)對基因信息數(shù)據(jù)總量達(dá)65PB的訪問支持。在9月22日正式營業(yè)前,國家基因庫已實現(xiàn)對基因信息數(shù)據(jù)60PB的訪問支持,正式運營當(dāng)天有5PB的數(shù)據(jù)正式對外發(fā)布,提供數(shù)據(jù)檢索和查詢功能。記者也注意到,國際基因庫的官網(wǎng)在9月22日當(dāng)天也已煥然一新,首頁就是數(shù)據(jù)庫檢所查詢的頁面。
如果以一部電影500MB計算,65PB(1TB=1024GB,1PB=1024TB)相當(dāng)于1.28億部電影,一個人一天看一部電影需要38萬年才能看完。
徐訊稱,基因技術(shù)看似高大上,大家以為會很少和自己有關(guān),但大家在日常生活中已經(jīng)無形中接觸到了很多基因技術(shù)。
比如,罕見病診斷治療方面,可以從基因數(shù)據(jù)上實現(xiàn)集中管理和追本溯源。比如國家正在腸道的精準(zhǔn)醫(yī)療就是建立在對人和跟人相關(guān)的外源性生物物種認(rèn)知的基礎(chǔ)上,要通過基因測序來了解遺傳規(guī)律、醫(yī)學(xué)范式,這時能否擁有更多基因資源、能否掌握更多遺傳規(guī)律就非常關(guān)鍵,未來精準(zhǔn)醫(yī)學(xué)的發(fā)展和競爭某種程度上取決于具有的基因資源以及認(rèn)知基因資源的能力。再比如,中國現(xiàn)在的出生缺陷發(fā)生率大概為5.6%,怎么預(yù)防出生缺陷就是一個很大的問題,所以做產(chǎn)前檢測、孕前監(jiān)測也都是通過基因的方法來排除的。同時,最近網(wǎng)上炒得比較火的基因編輯,如果沒有“讀懂”基因,那么基因編輯技術(shù)也就沒辦法進(jìn)一步發(fā)展,而“讀懂”的前提就是要有一個強大的基因庫。此外,在農(nóng)業(yè)育種方面,基因庫也大有作為。比如,袁隆平的超級水稻就是選擇合適的基因組進(jìn)行的組合。
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