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氫鍵的終點(diǎn)和化學(xué)鍵的起點(diǎn)在哪里?

發(fā)布人:深科技 時間:2021-10-10 來源:工程師 發(fā)布文章

化學(xué)鍵是重要的基礎(chǔ)化學(xué)概念。當(dāng)兩個原子共享一對電子時,會形成共價鍵,比如 N? 分子中的 NN 三鍵;而氫鍵,被認(rèn)為是一種基于靜電作用的特殊的化學(xué)鍵,一般與電負(fù)性較強(qiáng)的原子(F,O,N)相關(guān)聯(lián),分子間的氫鍵作用使得 HF 的沸點(diǎn)高于 HCl,這些知識對于一個高中生來說都并不陌生。

 

然而,最近來自芝加哥大學(xué)化學(xué)系的博士后研究員博格丹·德雷卡(Bogdan Dereka)等人研究了如果分子內(nèi)氫鍵的強(qiáng)度變得與分子間共價鍵的強(qiáng)度相當(dāng)會發(fā)生什么,并且找到了氫鍵向共價鍵轉(zhuǎn)變的中間態(tài),即強(qiáng)氫鍵(Strong Hydrogen Bonding, SHB),打破了科學(xué)家對于化學(xué)鍵的傳統(tǒng)認(rèn)知,其相關(guān)成果發(fā)表于 Science。目前,該論文在Google Scholar 中的被引次數(shù)已經(jīng)達(dá)到 33 次。

 

強(qiáng)氫鍵的特征在于其鍵能比普通氫鍵強(qiáng),且鍵長小于普通氫鍵,從而使其構(gòu)成了一個單獨(dú)的類別。此外,與傳統(tǒng)氫鍵相比,SHB 體系中的質(zhì)子被質(zhì)子供體 D 和質(zhì)子受體 A 同時擁有,即質(zhì)子成為一個封閉的粒子,在 D 和 A 之間脫域,這個特征與共價鍵中電子被共享的情形類似。由于 SHB 難以捉摸的特性,在過去幾十年中一直是一個爭論的焦點(diǎn)。

 


 

D-H 振動頻率隨著H鍵強(qiáng)度的增加而減少,這是 H 鍵的一個教科書式的特性。然而,基本頻率本身并不能夠用來描述質(zhì)子勢能。H 鍵中質(zhì)子的振動大大偏離了諧波振蕩,且影響 H 鍵的結(jié)構(gòu)、動力學(xué)和反應(yīng)性的因素不止一種。因此,我們需要找到一種有效的測試手段來表征不同氫鍵中的質(zhì)子,從而確定 HSB 的狀態(tài)。

 

在該論文中,德雷卡等人利用飛秒二維紅外光譜與量子化學(xué)計算相結(jié)合,展示了一種研究短程氫鍵性質(zhì)的有力方法。他們對水溶液中的雙氟化物陰離子 HF2- 模型系統(tǒng)中的多種耦合運(yùn)動進(jìn)行了定量分析,揭示了從傳統(tǒng) H 鍵到 SHB 的交叉的幾個明顯特征。下圖中,隨著 F-F 鍵長變化,從質(zhì)子供體和受體電荷分布的變化,可以非常明顯的觀察到 SHB 向傳統(tǒng) H 鍵的轉(zhuǎn)變。在 SHB 中,靜電作用只占 SHB 鍵能的52% 到 62%,而共價、電荷轉(zhuǎn)移和 Pauli 排斥在短程 D-A 距離上起著越來越大的作用。這些結(jié)果表明,SHB 位于氫鍵結(jié)束和化學(xué)鍵開始的臨界點(diǎn)上。

 


 

那么,這項基礎(chǔ)研究具有什么具體的意義呢?

 

首先,這項研究觸及了化學(xué)的基礎(chǔ),因為我們對化學(xué)鍵作為棍子或彈簧的理解并不是沒有爭議的。事實上,如何精確地定義這種“化學(xué)鍵”至今并沒有有效的方法,這個工作為探索定義、描述和理解化學(xué)鍵的新方法提供了新的思路。強(qiáng)氫鍵作為共價鍵-氫鍵的一種混合狀態(tài),可能會重塑我們對于化學(xué)反應(yīng)過程的理解,因為鍵的形成是化學(xué)反應(yīng)中非常重要的一個環(huán)節(jié)。

 

與此同時,強(qiáng)氫鍵的發(fā)現(xiàn)模糊了分子的界限。

 

“由共價鍵組成的分子中,原子是單個分子的一部分,而由氫鍵連接的原子可以保持獨(dú)立的實體。因此,介于兩者之間的紐帶衍生出一個問題:你什么時候才能從兩個分子變成一個分子?”。該論文的通訊作者安德烈·托卡科夫(Andrei Tokmakoff)在接受采訪時說道。



 

在化學(xué)轉(zhuǎn)換過程中,共價鍵經(jīng)常要轉(zhuǎn)換為較弱的 H 鍵,而水的質(zhì)子傳輸依賴于共價鍵和 H 鍵的不斷相互轉(zhuǎn)換。強(qiáng)氫鍵被認(rèn)為在氫離子的運(yùn)輸中發(fā)揮了作用,這一過程對各種生物機(jī)制至關(guān)重要,包括為細(xì)胞提供動力,且與燃料電池膜等技術(shù)相關(guān)。然而,這種轉(zhuǎn)換過程中的許多問題仍為解決,包括溶劑在這種相互轉(zhuǎn)換中起什么作用,什么分子運(yùn)動觸發(fā)了這些相互轉(zhuǎn)換,以及如何將這些系統(tǒng)引導(dǎo)到一個理想的方向。這些問題的答案將會對生物、材料等領(lǐng)域中有關(guān)質(zhì)子傳輸?shù)倪^程提供新的理論基礎(chǔ)。

 

安德烈·托卡科夫是芝加哥大學(xué)化學(xué)系教授,主要利用超快振動光譜和二維紅外光譜研究水溶液的分子動力學(xué)和生物物理過程,例如水的氫鍵網(wǎng)絡(luò)如何介導(dǎo)質(zhì)子的運(yùn)輸,蛋白質(zhì)如何折疊的分子細(xì)節(jié)等。有趣的是,該課題組在 2015 年利用超快二維紅外光譜研究了水溶液以何種形式容納多余的質(zhì)子,即酸在分子水平上是什么樣的,相關(guān)成果發(fā)表于 Science 。


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參考:

[1] Bogdan Dereka, Qi Yu, Nicholas H. C. Lewis, William B. Carpenter, Joel M. Bowman, Andrei Tokmakoff. Science 2021, 371, (6525), 160-164.

[2] ScienceNews, This weird chemical bond acts like a mash-up of hydrogen and covalent bonds.

[3] Mischa Bonn, Johannes Hunger. Between a hydrogen and a covalent bond. Science2021, 371, (6525), 123-124.


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